台灣海洋細菌的研究 (7) 細菌鑑定之脂肪酸分析(二)

誠如上回所言，影響細菌脂肪酸組成比例的因素很多，因此要利用它來進行菌株間分類鑑定的比對依據時，必須注意到培養條件的一致性。2010年前，論文審查者大多不太關心上述的問題，但因為工具和標準菌株的取得便利化以後，投稿人進行新菌種發表時，若要將脂肪酸列為主要比對項目，那麼，他們勢必要取得標準菌株，然後在相同培養條件，分析出菌株的脂肪酸組成，以利比對。

表1. 這是由本團隊2012年所發表的新型菌種Kangiella taiwanensis
與其它標準菌株的脂肪酸組成分比較。

脂肪酸萃取方法

細菌脂肪酸的取得係採用全細胞萃取法，即是除了細胞膜上的脂肪酸外，也會將細胞質中的脂肪酸一併取出。過去會為了定量先將細胞冷凍乾燥後，再行萃取，但後來因技術精進，便自平板培養基上刮取菌體，直接進行萃取脂肪酸，較早的萃取方法如圖一所示。

圖1 細菌細胞脂肪酸萃取步驟。

商業化的分析工具

Microbial IDentification Inc (MIDI) 成立於1991年，該公司開發了一套以細菌脂肪酸為鑑定依據的系統，依據其標準作業程序，收集並萃取出細胞脂肪酸，置入全自動化的GLC中，透過其資料庫比對分析，即可快速比對出未知分離株的近似種類；若是進行新菌種的脂肪酸組成分析，該系統亦會提供詳細的資料給使用者。

 

圖2. MIDI所提供的脂肪酸標準化步驟。(詳細可至該公司網站下載資料。)

 

後記：

早在二十多年前，台灣已經引進此系統，畢竟它的價格並不是一般的實驗室可以負擔，因此，食品工業發展研究所( FIRDI: Food Industry Research and Development Institute)轄下生物資源保存及研究中心 (Bioresource Collection and Research Center)提供商業化的代工服務，如果有需要可逕洽該單位。

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